近日,加利福尼亞州圣克拉拉市——安捷倫科技公司(紐約證交所:A)推出了 HaloPlex 靶向序列捕獲系統(tǒng)的加速版本,該版本適用于臺(tái)式測(cè)序儀。使用該系統(tǒng)后,從前需要大約 24 小時(shí)才能完成的實(shí)驗(yàn)方案,現(xiàn)在不到 6 小時(shí)便可輕松結(jié)束。這就意味著,用戶(hù)可在一個(gè)工作班次內(nèi)完成從樣品制備到測(cè)序的一系列流程。
“我們近期有機(jī)會(huì)參與了6小時(shí)操作流程的早期測(cè)試。應(yīng)用這一新流程,我們?cè)谠绯块_(kāi)始準(zhǔn)備文庫(kù),下午就可以開(kāi)始測(cè)序。”O(jiān)ntario癌癥研究所Andrew Brown說(shuō):“實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,無(wú)論是血液還是石蠟包埋樣本,也不論是900ng還是100ng的gDNA起始量,我們都可以清晰無(wú)誤地檢測(cè)出變異?!?BR>
新的 HaloPlex 系統(tǒng)只需要 200 ng DNA,僅僅是以前用量的四分之一,可以大大節(jié)省珍貴的樣品。HaloPlex 也可用于石蠟包埋樣本。該產(chǎn)品隨試劑盒配有 96 種不同的索引序列,支持同時(shí)對(duì)多個(gè)樣品進(jìn)行平行測(cè)序。
獨(dú)特的 HaloPlex 技術(shù)完美融合了聚合酶鏈反應(yīng)系統(tǒng)的速度和特異性以及基于液相雜交體系的可擴(kuò)展性和捕獲片段大小的靈活性。該實(shí)驗(yàn)方案無(wú)需文庫(kù)構(gòu)建,利用單管操作,從而解決了多重 PCR 由于存在交叉雜交問(wèn)題而使靶向序列數(shù)量受限的問(wèn)題。該實(shí)驗(yàn)方案適用于 Illumina MiSeq 臺(tái)式測(cè)序儀以及 HiSeq 和 GAIIx 測(cè)序儀。該工作流程比雜交捕獲和微流體 PCR 方法更加簡(jiǎn)便快捷。
Halo Genomics 創(chuàng)始人、現(xiàn)安捷倫 DNA 測(cè)序市場(chǎng)部主管 Olle Ericsson說(shuō)道:“HaloPlex 是一項(xiàng)創(chuàng)新技術(shù),在臺(tái)式測(cè)序和靶向序列捕獲廣泛用于臨床研究的當(dāng)今,使用該系統(tǒng)能夠產(chǎn)生巨大價(jià)值。這個(gè)版本運(yùn)行周期短、定制簡(jiǎn)單,能夠完全滿足行業(yè)需求?!?BR>
HaloPlex 是一款定制產(chǎn)品。用戶(hù)使用免費(fèi)的在線設(shè)計(jì)向?qū)В╓eb Design Wizard),在不到 10 分鐘時(shí)間內(nèi)就可完成設(shè)計(jì),富集數(shù)以千計(jì)的目標(biāo)基因組序列。
安捷倫于 2011 年 12 月收購(gòu)了位于瑞典烏普薩拉的 Halo Genomics 公司和 HaloPlex 平臺(tái)。這項(xiàng)新產(chǎn)品如今也受益于安捷倫強(qiáng)大的研發(fā)、生產(chǎn)和分銷(xiāo)資源。HaloPlex 技術(shù)完美補(bǔ)充了安捷倫 SureSelect 靶向序列捕獲系統(tǒng)。
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