2013年諾貝爾化學(xué)獎(jiǎng)揭曉 化學(xué)、生物學(xué)模擬終成正果
2013年諾貝爾化學(xué)獎(jiǎng)揭曉,美國(guó)三位科學(xué)家Martin Karplus, Michael Levitt與Arieh Warshel獲獎(jiǎng)。獲獎(jiǎng)理由為“為復(fù)雜化學(xué)系統(tǒng)創(chuàng)立了多尺度模型”。
Martin Karplus教授的得獎(jiǎng)是一個(gè)非常令人振奮的消息。因?yàn)檫@從根本上承認(rèn)了計(jì)算機(jī)模擬預(yù)測(cè)在化學(xué)、生物學(xué)領(lǐng)域的貢獻(xiàn)。回顧這幾十年生命科學(xué)模擬技術(shù)的發(fā)展,計(jì)算機(jī)已經(jīng)成為了化學(xué)家不可或缺的預(yù)測(cè)工具。預(yù)測(cè)準(zhǔn)確性也經(jīng)受住了重重考驗(yàn)。計(jì)算模擬與實(shí)驗(yàn)研究已緊密的結(jié)合在一起。
Karplus教授是量子化學(xué)和生物大分子的分子動(dòng)力學(xué)模擬方面的先驅(qū)。其中在生物大分子的研究中,Karplus教授建立了基于經(jīng)典牛頓力學(xué)的Charmm力場(chǎng),能夠?yàn)榛瘜W(xué)家提供處理各種小分子、生物大分子(包括蛋白質(zhì)、核酸和糖)的經(jīng)驗(yàn)化能量計(jì)算。并且開(kāi)發(fā)出了同名的CHARMM分子動(dòng)力學(xué)模擬軟件(目前是應(yīng)用最廣泛的分子動(dòng)力學(xué)工具)。能夠動(dòng)態(tài)的模擬生物大分子的運(yùn)動(dòng)過(guò)程。
有幸的是由創(chuàng)騰科技獨(dú)家代理的旗艦級(jí)的生命科學(xué)模擬預(yù)測(cè)軟件Accelrys Discovery Studio與Karplus教授實(shí)驗(yàn)室有著深度合作關(guān)系。在DS(Discovery Studio)中,生物大分子模擬的力場(chǎng),以及分子動(dòng)力學(xué)引擎均來(lái)自CHARMm。再加上Discovery Studio全球領(lǐng)先的所見(jiàn)即所得的可視化界面,能夠大大降低了研究者的學(xué)習(xí)門(mén)檻,幫助研究者輕松實(shí)現(xiàn)預(yù)測(cè)工作。
在最新的Discovery Studio 4.0中,新版本的CHARMm 37b2在計(jì)算規(guī)模和運(yùn)行效率上均得到了非常大的提升。特別是在長(zhǎng)時(shí)間的模擬當(dāng)中,運(yùn)行更加穩(wěn)定。并且基于新的Charmm36力場(chǎng),結(jié)構(gòu)更加準(zhǔn)確。(Discovery Studio 4.0版本由Accelrys公司向全球正式發(fā)布。創(chuàng)騰科技有限公司作為Discovery Studio中國(guó)的獨(dú)家代理,將于2013年11月11日下午14:00舉行中國(guó)大陸地區(qū)(含香港特區(qū))的Discovery Studio 4.0發(fā)布會(huì),點(diǎn)擊查看“Discovery Studio 4.0發(fā)布會(huì)邀請(qǐng)函”。)
Martin Karplus, Michael Levitt與Arieh Warshel的獲獎(jiǎng),使我們看到了計(jì)算模擬研究的強(qiáng)大威力。