斥巨資采購128臺基因測序儀,一舉成為全球最大的基因測序中心,全額收購美國納斯達(dá)克上市公司CompleteGenomics(下稱CG),改變中國生物科技企業(yè)被跨國企業(yè)單向并購的格局。華大基因向來不按套路出牌??此朴行┋偪竦呐e動,實際是華大基因建立技術(shù)優(yōu)勢的精心布局。華大基因的服務(wù)規(guī)模和測序團(tuán)隊是全球最大的,但在測序技術(shù)平臺上需購買大批設(shè)備和耗材。收購CG實現(xiàn)了資金技術(shù)的互補(bǔ),也使技術(shù)優(yōu)勢成為打破原有國際基因市場格局的反擊武器。
大數(shù)據(jù)支撐科研新模式
通常由于科學(xué)技術(shù)實現(xiàn)產(chǎn)業(yè)化的過程周期很長,但在生物科技領(lǐng)域,尤其是在21世紀(jì)以后,生命科學(xué)由原來經(jīng)典的實驗科學(xué)、作坊式的實驗科學(xué)變成了工廠式大數(shù)據(jù)的大科學(xué)。這種大科學(xué)利用數(shù)據(jù)分析處理,大大縮短了從科學(xué)發(fā)現(xiàn)到產(chǎn)業(yè)化的過程,使得一家機(jī)構(gòu)同時進(jìn)行產(chǎn)學(xué)研一體化成為了可能。
1990年由美、英、日、德、法及中國六國科學(xué)家啟動的“國際人類基因組計劃”,用10年時間、耗費30億美元才完成了一個人的基因組測序。2007年華大基因只用半年,不到3000萬人民幣就完成了“第一個中國人基因圖譜”。省時、高效的基因測序得益于華大基因在大數(shù)據(jù)背景下開創(chuàng)的新型基因科研模式,華大基因打造了具有全球競爭力的綜合性大平臺。在強(qiáng)大“平臺體系”驅(qū)動下,圍繞生命中心法則,建起了測序、質(zhì)譜、生物計算和國家基因庫綜合技術(shù)平臺。
測序平臺承載著基因測序產(chǎn)業(yè)的重任,它使人類進(jìn)一步解讀生命奧妙成為了可能。華大基因測序平臺主要以高通量測序平臺為主,此外,還包括了羅氏454測序平臺及IonTorrent測序平臺。測序涉及生物學(xué)各領(lǐng)域,包括DNA測序、RNA測序、宏基因組測序、甲基化測序、外顯子捕獲測序等。此外,還有合成平臺、基因分型平臺、全基因酶切圖譜平臺等讓測序結(jié)果更精確的輔助平臺。
質(zhì)譜平臺基于高通量質(zhì)譜技術(shù)進(jìn)行工業(yè)規(guī)模的蛋白質(zhì)組學(xué)、代謝組學(xué)研究及目標(biāo)分子檢測,主要進(jìn)行蛋白質(zhì)組學(xué)和代謝組學(xué)的全譜分析、定量分析、蛋白修飾分析以及目標(biāo)蛋白、多肽和各種小分子的分析檢測,也可以結(jié)合基因組、轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)展開貫穿性科研項目。
信息中心以實現(xiàn)超大規(guī)模生物信息學(xué)計算為中心任務(wù),不斷提升其在高效能計算、云計算服務(wù)能力,為海量數(shù)據(jù)處理提供創(chuàng)新解決方案。華大基因擁有深圳、香港、北京、武漢、杭州等數(shù)個大型生物信息學(xué)超級計算中心,總峰值計算能力達(dá)到212Tflops,總內(nèi)存容量達(dá)到35.9TB,總存儲能力達(dá)到18.38PB。其位于深圳和香港的集群的峰值計算能力分列國內(nèi)生物信息領(lǐng)域第一和第二位,有能力為海量生物信息學(xué)數(shù)據(jù)的存儲、處理和分析提供穩(wěn)定而高效的資源保障。
國家基因庫集生物資源樣本庫、生物信息數(shù)據(jù)庫和生物資源信息網(wǎng)絡(luò)為一體,通過建立高水平的生物資源樣本庫、高效的生物信息數(shù)據(jù)處理、存儲與管理系統(tǒng)以及覆蓋廣泛的聯(lián)盟網(wǎng)絡(luò),有效保護(hù)、合理開發(fā)和利用我國生物資源及基因數(shù)據(jù)資源,充分調(diào)動、發(fā)揮及整合各地區(qū)、各單位的資源和技術(shù)優(yōu)勢,積極開展廣泛交流與合作。
競爭王牌:測序技術(shù)革新
2013年3月18日,華大基因宣布完成對CG的全額收購。華大在并購?fù)瓿芍螅A袅薈G在硅谷的研發(fā)團(tuán)隊,并將團(tuán)隊規(guī)模擴(kuò)大了一倍,同時結(jié)合中國本土的經(jīng)驗豐富的研發(fā)團(tuán)隊共同合作,開發(fā)出將投入產(chǎn)業(yè)化應(yīng)用的臨床測序技術(shù)BGISEQ-1000和BGISEQ-100。新產(chǎn)品大大簡化了樣品處理的流程,縮短了整個周期,優(yōu)化了生物云平臺,做到一鍵式、傻瓜式、大數(shù)據(jù)庫支持,能夠進(jìn)入任何一家醫(yī)院而不需要任何前期測序基礎(chǔ)。在臨床產(chǎn)品的精度、可重現(xiàn)性和穩(wěn)定性方面比市面已有技術(shù)提高幾個數(shù)量級,達(dá)到99.999%以上的堿基準(zhǔn)確性。
華大的測序技術(shù)采取的原理各有不同,其中代表性的有基于焦磷酸化學(xué)發(fā)光的454測序技術(shù)、基于連接反應(yīng)的邊連接邊測序技術(shù)SBL、基于錨定探針連接的CPAL技術(shù)、基于可逆終止邊合成邊連接技術(shù)(SBS)和測序過程中基于氫質(zhì)子濃度變化的半導(dǎo)體檢測技術(shù)。
華大測序的特點主要是序列短(30—150bp)、但是檢測通量大(從開始的幾百Mb到目前的1Tb以上的通量)、檢測周期靈活(幾個小時到幾天)。正是因為通量高,所以測序的價格已經(jīng)是第一代測序的萬分之一,甚至更低。最早做一個人類基因組測序需要30億美元,現(xiàn)在測序成本只需要1000美元。
如今,華大基因在基因測序領(lǐng)域保持著領(lǐng)先的技術(shù)優(yōu)勢,包括效率高、成本低的高通量測序;準(zhǔn)確率高的高深度測序;全球領(lǐng)先的基因組組裝軟件,自主研發(fā)的SOAPdenovo軟件;而且有著豐富的經(jīng)驗,華大基因已經(jīng)成功完成幾百個物種的全基因組從頭測序。
產(chǎn)業(yè)化新起點
如今,華大基因已經(jīng)進(jìn)入到產(chǎn)業(yè)化的新階段,除了傳統(tǒng)的科技合作項目之外,個人基因檢測服務(wù)于醫(yī)療領(lǐng)域,成為了華大基因發(fā)展的新起點。
全世界每年約有500萬缺陷兒出生,給這些家庭造成了巨大的精神和經(jīng)濟(jì)負(fù)擔(dān)。產(chǎn)前篩查、產(chǎn)前診斷是防治出生缺陷的重要方法之一,但是目前的方法都無法達(dá)到既精準(zhǔn)又安全無創(chuàng)。近年來隨著高通量測序技術(shù)的發(fā)展,DNA測序成本降低,一項新的產(chǎn)前檢測技術(shù)——無創(chuàng)產(chǎn)前基因檢測技術(shù)應(yīng)運而生。華大基因在自身高通量測序平臺的基礎(chǔ)上,于2010年末推出了產(chǎn)前基因檢測服務(wù),只需通過采集孕婦外周血,提取血漿中的游離DNA,就可利用測序方法分析胎兒患染色體非整倍性疾病的風(fēng)險率。目前,除無創(chuàng)產(chǎn)前基因檢測技術(shù)外尚有針對染色體病、單基因病的眾多項目在研發(fā)過程中。
目前全球基因測序領(lǐng)域處于一個快速向應(yīng)用轉(zhuǎn)化的產(chǎn)業(yè)化、民用化發(fā)展階段。整個基因測序市場中從業(yè)公司的估值也都將隨著產(chǎn)業(yè)的爆發(fā)而水漲船高,該領(lǐng)域前景將繼續(xù)受到投資者和資本市場的廣泛關(guān)注。
基因科技,這個揭示人類生命奧秘的學(xué)科,未來必將孕育出全世界最大、最重要的產(chǎn)業(yè)市場。