作為此計(jì)劃的一部分，將AB Sciex的SWATH™ 蛋白質(zhì)組學(xué)云工具將托管在Illumina的BaseSpace應(yīng)用商店中。這種伙伴關(guān)系將使BaseSpace成為基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)“大數(shù)據(jù)”的一站式中心。
傳統(tǒng)的“鳥槍法”蛋白質(zhì)組學(xué)在測定不完整的蛋白質(zhì)時(shí)難以重復(fù)，而AB SCIEX的SWATH™蛋白質(zhì)組學(xué)軟件解決了這種“數(shù)據(jù)丟失問題”，首次使許多樣品的蛋白質(zhì)組學(xué)重復(fù)研究變得可行，并通過集成Illumina的新一代基因測序技術(shù)得到進(jìn)一步增強(qiáng)。
SWATH™蛋白質(zhì)組學(xué)軟件是一種專利創(chuàng)新技術(shù)，采用非數(shù)據(jù)依賴的采集方法，能夠系統(tǒng)地生成完全的、高特異性的碎片離子全貌圖，通過使用目標(biāo)數(shù)據(jù)分析法可以查詢?nèi)魏胃信d趣的蛋白質(zhì)是否存在，并對其定量。
AB Sciex公司總裁Rainer Blair表示：“SWATH™軟件幾乎不需要方法開發(fā)，就能夠一次查看成千上萬個(gè)蛋白質(zhì)。基于云端應(yīng)用程序后，客戶數(shù)據(jù)處理速度將提高50倍。OneOmics™項(xiàng)目將使組學(xué)研究獲得更好的成果。我們已經(jīng)開發(fā)了四個(gè)SWATH app支持質(zhì)譜數(shù)據(jù)的處理、分析和查看?！?/P>
這四個(gè)應(yīng)用程序分別為：
• Protein Expression Extracto-處理原始質(zhì)譜數(shù)據(jù)
• Protein Expression Assembler-蛋白質(zhì)折疊變化分析
• Protein Expression Browser-在生物學(xué)背景下查看結(jié)果
• Protein Expression Analytics-數(shù)據(jù)質(zhì)量審核
近年來，NGP和NGS都在不斷產(chǎn)生大量的數(shù)據(jù)。AB Sciex與Illumina這種伙伴關(guān)系能夠幫助安全存儲(chǔ)、檢索和管理大型的復(fù)雜數(shù)據(jù)集，并在生物學(xué)背景下查看它們，解決了生物醫(yī)學(xué)研究中的一個(gè)瓶頸。
對此，Illumina企業(yè)發(fā)展高級副總裁兼企業(yè)信息總經(jīng)理Nicholas Naclerio說到：“這些新的蛋白質(zhì)組學(xué)工具為BaseSpace增加了系統(tǒng)生物學(xué)能力，創(chuàng)建了一個(gè)易于使用的云計(jì)算環(huán)境，實(shí)現(xiàn)了快速數(shù)據(jù)分析?，F(xiàn)在，BaseSpace讓希望從系統(tǒng)水平了解生物學(xué)的任何人都能應(yīng)用信息學(xué)。”
