近日,PacBio公司首席安全官Jonas Korlach在官網(wǎng)上發(fā)表博客表示,PacBio公司計(jì)劃提高PacBio RS II測序平臺(tái)的通量,使每SMRT cell一次運(yùn)行可輸出超過4GB數(shù)據(jù),平均讀取長度增加到15-20KB。
去年秋天該公司升級了測序聚合酶和化學(xué)染料(P6-C4),使每SMRT cell 數(shù)據(jù)輸出量從0.5G提升到1GB,平均讀長達(dá)到10-15KB。最初的PacBio RS II平臺(tái),一天運(yùn)行16個(gè)SMRT Cell只能產(chǎn)生6.4G的原始數(shù)據(jù)。
PacBio公司計(jì)劃通過提升化學(xué)試劑,操作流程及軟件來提高測序質(zhì)量。包括將單一聚合酶加載到芯片上,從而提高裝載效率。
此外,該公司計(jì)劃提升樣本制備流程并將其簡單化,為混合樣本添加條形碼,發(fā)布長插入片段和全長cDNA文庫的操作手冊。
在數(shù)據(jù)分析方面,PacBio公司計(jì)劃與生物信息學(xué)團(tuán)隊(duì)合作開發(fā)更快的de novo組裝基因組的算法,進(jìn)一步開發(fā)Falcon assembler及其他軟件來解決二倍體或多倍體基因組的分析工作,簡化全長轉(zhuǎn)錄本測序、Iso-Seq™全長轉(zhuǎn)錄本/異構(gòu)體測序以及人類白細(xì)胞抗原(HLA)單體型定相的工作流程。