第一篇文章報(bào)道了通過(guò)單顆粒冷凍電子顯微技術(shù)(冷凍電鏡)解析的酵母剪接體近原子分辨率的三維結(jié)構(gòu),第二篇文章在此結(jié)構(gòu)的基礎(chǔ)上進(jìn)行了詳細(xì)分析,闡述了剪接體對(duì)前體信使RNA執(zhí)行剪接的基本工作機(jī)理。清華大學(xué)生命學(xué)院閆創(chuàng)業(yè)博士、醫(yī)學(xué)院博士研究生杭婧和萬(wàn)蕊雪為兩篇文章的共同第一作者。
這一研究成果具有極為重大的意義。自1993年RNA剪接的發(fā)現(xiàn)以來(lái),科學(xué)家們一直在步履維艱地探索其中的分子奧秘,期待早日揭示這個(gè)復(fù)雜過(guò)程的分子機(jī)理。施一公院士研究組對(duì)剪接體近原子分辨率結(jié)構(gòu)的解析,不僅初步解答了這一基礎(chǔ)生命科學(xué)領(lǐng)域長(zhǎng)期以來(lái)備受關(guān)注的核心問(wèn)題,又為進(jìn)一步揭示與剪接體相關(guān)疾病的發(fā)病機(jī)理提供了結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)和理論指導(dǎo)。
清華大學(xué)將于近期召開(kāi)新聞發(fā)布會(huì),介紹這項(xiàng)重大的科研成果。
另?yè)?jù)《賽先生》對(duì)施一公的一篇專(zhuān)訪介紹,“這項(xiàng)研究成果的意義很可能超過(guò)了我過(guò)去25年科研生涯中所有研究成果的總和!”施一公振奮地表示:“我此前以通訊作者身份在《科學(xué)》、《自然》和《細(xì)胞》上發(fā)表的文章總共接近50篇,但我覺(jué)得這次的意義特別重大!”
6月24日,Nagai研究組的一篇論文于《自然》網(wǎng)站在線發(fā)表,其工作將剪接體所涉及的一個(gè)中心復(fù)合物tri-snRNP的分辨率提高到了5.9個(gè)埃米,一度引起轟動(dòng)。而此前人類(lèi)對(duì)基因剪接體的認(rèn)識(shí)精度只有29個(gè)埃米。1埃米為10-10米,即把1米分成十億份,其之微小可以想見(jiàn),因此Nagai的最新工作被稱(chēng)為近原子尺度的結(jié)構(gòu)研究。
而施一公團(tuán)隊(duì)此次得到的結(jié)果不僅將精度由5.9個(gè)埃米提高到了3.6個(gè)埃米,而且其解析對(duì)象是真正的剪接體,而不是Nagai團(tuán)隊(duì)所取得的參與剪接體組裝過(guò)程的復(fù)合物,從而第一次在近原子分辨率上看到了剪接體的細(xì)節(jié)。
對(duì)于施一公團(tuán)隊(duì)的最新成果,很多同行給出了非常高的評(píng)價(jià):將受諾獎(jiǎng)考慮。
一直以來(lái),研究蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)有三種主要方法:X射線晶體衍射、核磁共振以及單顆粒冷凍電子顯微鏡(冷凍電鏡)。而施一公所采用的冷凍電鏡技術(shù)在過(guò)去兩年里取得了革命性的進(jìn)展,一方面是它的照相機(jī)技術(shù),一方面是其軟件分析的圖像處理技術(shù),尤其是前者的進(jìn)步大幅提高了冷凍電鏡的解析能力。
施一公說(shuō):“如果沒(méi)有冷凍電鏡技術(shù),就完全不可能得到剪接體近原子水平的分辨率。”
尤為幸運(yùn)的是,早在冷凍電鏡技術(shù)還遠(yuǎn)未成勢(shì)的2007年,清華大學(xué)就在上述三種方法中選擇了重點(diǎn)發(fā)展冷凍電鏡技術(shù),如今清華擁有世界最大的冷凍電鏡系統(tǒng)。施一公把他和同事們當(dāng)年卓有遠(yuǎn)見(jiàn)的選擇歸于“幸運(yùn)”,他說(shuō)“如果沒(méi)有冷凍電鏡肯定做不到今天的結(jié)果,而當(dāng)年確實(shí)沒(méi)想到冷凍電鏡會(huì)出現(xiàn)飛躍性的進(jìn)展。”
“幸運(yùn)”遠(yuǎn)不止是當(dāng)年選對(duì)了技術(shù)。除了儀器的進(jìn)步,在施一公看來(lái),他們能領(lǐng)先競(jìng)爭(zhēng)對(duì)手的主要原因是擁有極為成熟的樣品處理方法。“也就是說(shuō)如何讓蛋白質(zhì)服服帖帖、性質(zhì)穩(wěn)定,成為適合結(jié)構(gòu)解析的樣品”,他半開(kāi)玩笑地說(shuō)“這是我們的獨(dú)門(mén)絕招,這個(gè)絕招即便寫(xiě)出來(lái),別人不在我的實(shí)驗(yàn)室做上一兩年也很難理解或吃透,因?yàn)檫@是師傅帶徒弟一點(diǎn)點(diǎn)積累起來(lái)的。”
除了靠譜的儀器、技術(shù)和學(xué)生,施一公說(shuō),“膽量”給了他們最大的驚喜。“本來(lái)我們的樣品不是最理想的狀態(tài),學(xué)生有點(diǎn)不敢試,我說(shuō)不妨上一下試試,最多就是不成功,只要有15埃的分辨率就很好了,結(jié)果算出來(lái)竟然有3.6埃。我們?cè)诮衲暾麄€(gè)4月份里做計(jì)算,那一個(gè)月突破連連、都跟做夢(mèng)似的!”