NHGRI所長(zhǎng)Green博士表示：“DNA測(cè)序的發(fā)展可幫助我們進(jìn)一步探索人類(lèi)疾病產(chǎn)生過(guò)程中基因是如何發(fā)揮作用的。我們將持續(xù)關(guān)注常見(jiàn)疾病和罕見(jiàn)疾病，希望能夠揭示一些重要的基因信息。”
CCDG的研究人員計(jì)劃先對(duì)一組疾病、15萬(wàn)~20萬(wàn)個(gè)患者進(jìn)行基因組測(cè)序，在基因組水平研究常見(jiàn)疾病產(chǎn)生的原因，及基因組的差異是如何影響患病風(fēng)險(xiǎn)的，同時(shí)也將開(kāi)發(fā)出一套研究模型用于今后常見(jiàn)疾病的研究。CMG研究者將建立一個(gè)國(guó)際研究合作網(wǎng)絡(luò)，對(duì)世界范圍內(nèi)存在的罕見(jiàn)疾病進(jìn)行基因組測(cè)序。這兩個(gè)項(xiàng)目通過(guò)研究引發(fā)疾病的基因以及基因組變異，有助于對(duì)疾病的診斷和潛在治療。
NHGRI將在未來(lái)四年內(nèi)分別資助CCDG和CMG項(xiàng)目2.4億美元和4千萬(wàn)美元，同時(shí)出資約400萬(wàn)美元資助一個(gè)新的協(xié)調(diào)中心，促進(jìn)這些項(xiàng)目者之間的合作、數(shù)據(jù)的分析和項(xiàng)目的推廣。
除此之外，美國(guó)國(guó)家心臟、肺和血液學(xué)研究所(NHLBI)將同時(shí)資助CCDG和CMG項(xiàng)目，美國(guó)國(guó)家眼科研究所(NEI)將為CMG項(xiàng)目提供資助，這兩個(gè)機(jī)構(gòu)同屬于NIH。
CCDG項(xiàng)目的開(kāi)展代表著NHGRI的基因組測(cè)序計(jì)劃(GSP)又向前邁出了一大步。最早期階段，GSP是NIH對(duì)人類(lèi)基因組計(jì)劃的重要貢獻(xiàn)。隨著DNA測(cè)序成本的降低，GSP開(kāi)始將重心轉(zhuǎn)移到大規(guī)模基因組測(cè)序項(xiàng)目上，并組織成立 了“大規(guī)?；蚪M測(cè)序和分析中心”。這些測(cè)序中心進(jìn)行了一系列開(kāi)創(chuàng)性的基因組學(xué)研究，包括千人基因組計(jì)劃，對(duì)世界各地不同人群中數(shù)千人進(jìn)行基因組測(cè)序，記錄不同個(gè)體的基因組差異性;和癌癥基因組圖譜(TCGA)計(jì)劃，由NHGRI和美國(guó)國(guó)家癌癥研究所合作，記錄癌癥相關(guān)的基因組變異信息。
常見(jiàn)疾病基因組學(xué)中心(CCDG)
高血壓、糖尿病以及精神疾病等常見(jiàn)疾病影響世界范圍內(nèi)數(shù)億的人群，然而到目前為止我們都無(wú)法解釋這些疾病產(chǎn)生的根源，因?yàn)樗鼈兊陌l(fā)生往往源自基因和環(huán)境因素的雙重作用。
CCGD研究人員將首先關(guān)注心血管/代謝疾病以及神經(jīng)精神性疾病，同時(shí)考慮研究其他疾病包括炎癥/自身免疫病、骨骼疾病，阿茲海默癥等。每一種常見(jiàn)疾病都代表著一系列的健康問(wèn)題，從發(fā)病年齡到潛在的生物學(xué)改變都各不相同。對(duì)于每一種疾病，CCDG研究人員都將對(duì)數(shù)萬(wàn)個(gè)患者及正常對(duì)照人群進(jìn)行基因組測(cè)序，NHGRI也將挑選一些其他疾病用于該中心后續(xù)的研究。
NHGRI基因組測(cè)序計(jì)劃負(fù)責(zé)人Felsenfeld博士說(shuō)：“該中心的研究人員計(jì)劃利用基因測(cè)序，盡可能廣泛地檢測(cè)出與常見(jiàn)疾病相關(guān)的基因和基因組變異。這些基因信息將在我們的臨床管理中起到非常大的作用。”
NHGRI將在未來(lái)四年中為四個(gè)中心提供約2.4億美金，NHLBI則額外提供2000萬(wàn)美金，具體資助情況如下：
1. 圣路易斯華盛頓大學(xué);6000萬(wàn)美元，4年
主要研究人員：Richard Wilson, Ph.D.
2. 麻省理工學(xué)院-哈佛大學(xué)博德研究所;8000萬(wàn)美元，4年
主要研究人員：Eric Lander, Ph.D., Mark Daly, Ph.D., Stacey Gabriel, Ph.D.和Sekar Kathiresan, M.D.
3. 休斯頓貝勒醫(yī)學(xué)院;6000萬(wàn)美元，4年
主要研究人員：Richard Gibbs, Ph.D.
4. 紐約基因組中心;4000萬(wàn)美元，4年
主要研究人員：Robert Darnell, M.D., Ph.D.
孟德?tīng)柣蚪M學(xué)中心(CMG)
NHGRI自2011年啟動(dòng)了CMG計(jì)劃，總體目標(biāo)是從基因組學(xué)角度系統(tǒng)地分析孟德?tīng)栠z傳病產(chǎn)生的原因，這類(lèi)疾病通常是由單基因突變引發(fā)的罕見(jiàn)疾病。到目前為止，已經(jīng)發(fā)現(xiàn)了7400多種孟德?tīng)柤膊?，并闡明了其中4300種疾病的潛在致病基因變異信息。
在過(guò)去的四年中，CMG研究人員對(duì)超過(guò)2萬(wàn)個(gè)人的蛋白編碼區(qū)進(jìn)行測(cè)序分析，發(fā)現(xiàn)超過(guò)740種致病基因，同時(shí)開(kāi)發(fā)出一種分析工具可快速查找這些致病基因。
CMG計(jì)劃負(fù)責(zé)人Wang博士介紹說(shuō)：“罕見(jiàn)疾病為我們進(jìn)行罕見(jiàn)和常見(jiàn)疾病的生物學(xué)研究提供了重要資源。CMG研究人員將繼續(xù)利用基因測(cè)序和分析尋找孟德?tīng)柤膊‘a(chǎn)生的致病基因，尤其是發(fā)現(xiàn)新的致病基因。”
NHGRI將資助4000萬(wàn)美元支持CMG計(jì)劃，同時(shí)NHLBI和NEL也將分別資助800萬(wàn)美元和100萬(wàn)美元用于該計(jì)劃實(shí)施。具體資助情況如下：
1. 麻省理工學(xué)院-哈佛大學(xué)博德研究所;1340萬(wàn)美元，4年
主要研究人員：Daniel MacArthur, Ph.D.和Heidi Rehm, Ph.D.
2. 耶魯大學(xué);1200萬(wàn)美元，4年
主要研究人員：Richard Lifton, M.D., Ph.D., Murat Gunel, M.D., Shrikant Mane, Ph.D.和MarkGerstein, Ph.D.
3. 西雅圖華盛頓大學(xué)和休斯頓貝勒醫(yī)學(xué)院，1200萬(wàn)美元，4年
主要研究人員：Deborah Nickerson, Ph.D. (華盛頓大學(xué)), Michael Bamshad, M.D. (華盛頓大學(xué)) and Suzanne Leal, Ph.D. (貝勒醫(yī)學(xué)院)
4. 約翰霍普金斯大學(xué)和貝勒醫(yī)學(xué)院，1160萬(wàn)美元，4年
主要研究人員：David Valle, M.D. (約翰霍普金斯大學(xué)) 和 JamesLupski, M.D., Ph.D. (貝勒醫(yī)學(xué)院)
GSP協(xié)調(diào)中心
GSP協(xié)調(diào)中心將促進(jìn)項(xiàng)目者間的合作并進(jìn)行項(xiàng)目推廣活動(dòng)，提升測(cè)序數(shù)據(jù)的利用率，并引導(dǎo)進(jìn)行各種不同的數(shù)據(jù)分析工作。
NHGRI將提供以下資助：
1. 美國(guó)羅格斯大學(xué);400萬(wàn)，4年;
主要人員：Tara Matise, Ph.D.和Steven Buyske, Ph.D.
