《辦法》提出，主管部門(mén)應(yīng)當(dāng)在每年9月底之前提出下年通過(guò)基本科研業(yè)務(wù)費(fèi)支持的行業(yè)基礎(chǔ)性、支撐性、應(yīng)急性科研工作的具體任務(wù)?？蒲性核鶓?yīng)當(dāng)在每年度終了后三個(gè)月內(nèi)，向主管部門(mén)提交年度經(jīng)費(fèi)使用情況報(bào)告。
《辦法》強(qiáng)調(diào)，科研院所可以使用基本科研業(yè)務(wù)費(fèi)聯(lián)合院(所)外單位共同開(kāi)展研究工作。合作研究經(jīng)費(fèi)一般不能撥至科研院所以外單位，確需外撥時(shí)應(yīng)經(jīng)管理咨詢(xún)委員會(huì)審議通過(guò)，并簽訂科研任務(wù)合同等。
科研院所基本科研業(yè)務(wù)費(fèi)中支持40歲以下青年科研人員牽頭負(fù)責(zé)科研工作的比例，一般不得低于年度預(yù)算的30%。
《辦法》還提出，基本科研業(yè)務(wù)費(fèi)具體開(kāi)支范圍由科研院所按照國(guó)家有關(guān)科研經(jīng)費(fèi)管理規(guī)定，結(jié)合本單位實(shí)際情況確定。但不得開(kāi)支有工資性收入的人員工資、獎(jiǎng)金、津補(bǔ)貼和福利支出，不得分?jǐn)傇核补芾砗瓦\(yùn)行費(fèi)用(含科研房屋占用費(fèi))，不得開(kāi)支罰款、捐贈(zèng)、贊助、投資等。
此外，《辦法》要求，基本科研業(yè)務(wù)費(fèi)所發(fā)生的會(huì)議費(fèi)、差旅費(fèi)、小額材料費(fèi)和測(cè)試化驗(yàn)加工費(fèi)等，應(yīng)當(dāng)按照《財(cái)政部科技部關(guān)于中央財(cái)政科研項(xiàng)目使用公務(wù)卡結(jié)算有關(guān)事項(xiàng)的通知》規(guī)定實(shí)行“公務(wù)卡”結(jié)算。勞務(wù)費(fèi)、專(zhuān)家咨詢(xún)費(fèi)等支出，原則上應(yīng)當(dāng)通過(guò)銀行轉(zhuǎn)賬方式結(jié)算，從嚴(yán)控制現(xiàn)金支付。
基本科研業(yè)務(wù)費(fèi)的資金支付應(yīng)按照國(guó)庫(kù)集中支付制度有關(guān)規(guī)定執(zhí)行，屬于政府采購(gòu)范圍的，應(yīng)當(dāng)按照政府采購(gòu)的有關(guān)規(guī)定執(zhí)行。
《辦法》指出，基本科研業(yè)務(wù)費(fèi)項(xiàng)目實(shí)施期間年度剩余資金可結(jié)轉(zhuǎn)下一年度繼續(xù)使用。連續(xù)兩年未用完或者完成任務(wù)目標(biāo)并通過(guò)驗(yàn)收、項(xiàng)目中止等形成的剩余資金，報(bào)財(cái)政部確認(rèn)為可留歸單位使用的結(jié)余資金后，由科研院所按照基本科研業(yè)務(wù)費(fèi)的管理和使用要求在2年內(nèi)統(tǒng)籌安排。
